Originally Posted by
Dan1113
Only for a few days, essentially working from CZ over through to AT (Linz>Salzburg>Innsbruck) and then into CH from there.

That's a lot more expensive than I was expecting!
For CZ, nearly every govt page and article I have found just says that foreigners from orange/red countries need a test to enter, but one page only, says that foreigners from orange/red countries still are not allowed entry for tourism purposes, even if they have a test (
here). I've emailed the govt to try to get clarification.
Unfortunatelly, the source you linked is correct. Residents of medium-risk countries won't be able to enter at all.
This is the legal document. Quote:
S účinností ode dne 15. června 2020 od 00:00 hod. se
I. nařizuje
1.zákaz vstupu na území České republiky pro všechny cizince, kteří neměli ke dni 12. března 2020 na území České republiky přechodný pobyt nad 90 dnů, nebo trvalý pobyt; to neplatí:
...
o) pro občany Evropské unie s vydaným potvrzením o přechodném pobytu nebo s trvalým pobytem v členských státech Evropské unie a dalších státech schengenské prostoru s nízkým rizikem nákazy onemocnění COVID-19 uvedených vbodu III./4. a jejich rodinné příslušníky ve smyslu §15a odst. 1 zákona č. 326/1999 Sb., o pobytu cizinců na území České republiky a o změně některých zákonů, ve znění pozdějších předpisů, a cizince spřiznaným postavením dlouhodobě pobývajícího rezidenta členského státu Evropské unie nebo dalšího státu schengenské prostoru snízkým rizikemnákazy onemocnění COVID-19uvedených vbodu III./4.a jejich rodinné příslušníky ve smyslu § 15a odst. 1 zákona č.326/1999 Sb., o pobytu cizinců na území České republiky a o změně některých zákonů, ve znění pozdějších předpisů,
It essentially says that from 15th of June 2020, it is forbiden to enter Czechia to all foreign nationals who weren't Czech residents on 12th of March 2020 - that doesn't apply to list of exception below. The exception reads "for citizens of the European Union with confirmation of temporary residence, or permanent residence in a member state of the European Union or other states of Schengen Area with low risk of COVID-19 infection" (followed by legal giberish).
That means residents of medium-risk countries won't be admitted.
Regarding the AT border discussed above. I took a short trip to Austria today. I entered via the highway border crossing at A6 and there was a brief police check. I showed my (Slovak) ID card and was let in. The car with CZ licence plates that was queueing in front of me got a bit longer treatment (maybe a minute). I returned via Berg border crossing and there was no Austrian police presence in either direction, therefore no one was checking people going into Austria. There was a bored Slovak policeman, but he didn't seem to care about anyone.